軟件與生物之基因芯片
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1、基因芯片綜合分析軟件。
ArrayVision7.0一種功能強大的商業版基因芯片分析軟件,不僅可以進行圖像分析,還可以進行數據處理,方便protocol的管理功能強大,商業版正式版:6900美元。
Arraypro4.0MediaCybernetics公司的產品,該公司的gelpro,imagepro一直以精確成為同類產品中的佼佼者,相信arraypro也不會差。
phoretix?ArrayNonlinearDynamics公司的基因片綜合分析軟件。
J-express挪威Bergen大學編寫,是一個用JAVA語言寫的應用程序,界面清晰漂亮,用來分析微矩陣(microarray)實驗獲得的.基因表達數據,需要下載安裝JAVA運行環境JRE1.2後(5.1M)後,才能運行。
2、基因芯片閲讀圖像分析軟件。
ScanAlyze2.44,斯坦福的基因芯片基因芯片閲讀軟件,進行微矩陣熒光圖像分析,包括半自動定義格柵與像素點分析。輸出為分隔的文本格式,可很容易地轉化為任何數據庫。
3、基因芯片數據分析軟件。
Cluster斯坦福的對大量微矩陣數據組進行各種簇(Cluster)分析與其它各種處理的軟件。SAMSignificanceAnalysisofMicroarrays的縮寫,微矩陣顯著性分析軟件,EXCEL軟件的插件,由Stanford大學編制。
4.基因芯片聚類圖形顯示。
TreeVieiga2.0的換代產品,accelrys公司Discoverystudio系列,accelrys公司的insightII,GCG是業內蛋白分析和核酸分析的權威軟件,DSgene是GCG的個人機簡版,功能強大,而且可以直接與GCG服務器相連。由於受到vectorNTI的界面影響,DSgene與Omiga2.0相比界面有了很大的改變。
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