如何計算北京的社會保險、公積金、個人所得税？

我面試時跟公司談的工資是税前4000元，到公司後才知道，4000元中有20%是績效工資，也就是要按照實際完成任務的指標來發放，並且是3個月一發。試用期兩個月，試用期是發的所談工資的80%，並不計績效，轉正才開始計算績效工資。

第一個月和第二個月發到手裏的實際工資為3060多元，我想是4000*80%減去個税後所得的.，不計遲到請假等扣款。因為公司的原因，第三個月沒及時辦轉正手續，第三個月發的跟前兩月一樣。第四個月我轉正了，公司説我是正常轉正，可以補上前幾個月的保險。第四個月發工資了，我只有2400多元，我不知道那些錢是怎麼給我扣沒了的。

我是北京市户口，社保上過一年半，是間隔上的，因為有一年斷了。請相關的權威人士給我解答，謝謝了，十分送上!