生物信息學研究中高通量數據分析的一些套路
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研究目的:從大量數據中篩選出感興趣的基因(包括編碼基因和非編碼基因)。通過下列步驟進行分析和驗證:
1.通過生物信息學的方法篩選出候補集合。(中間包括濾除各種噪聲或者誤差。)
2.定性分析:Reverse Transcription PCR(RT)。看看有沒有。
3.定量分析:Quantification PCR。有的話多不多。
4.定全長。RACE。
5.生物功能研究。
可以採用敲除和過表達的方式,並使用chip-seq免疫共沉澱技術,找出該基因和已知蛋白的關係。如果找到已知的蛋白,可以繼續研究和該蛋白相互作用的蛋白以及target等的研究。如果效果比較好,可以使用細胞模型,如果細胞模型比較好,可以繼續上動物模型,如果動物模型好,可以繼續上臨牀。這樣一篇新英格蘭級別的文章就誕生了。呵呵。
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